数据一致性
CGE 数据库在平衡过程中可能牺牲部分地区或少数部门的真实性。需与农业专家共同判断部门经济活动及投入产出关系是否属实，必要时调整原始数据库。
部门细化
全球模型中农业部门约 14 类，合并程度较高；中国 CGE 中农业部门更少。可借鉴 Mark Horridge 教授的 SplitCOM 程序，将玉米从谷物（GRO）、大豆从油料作物（OIL）等拆出。国家模型则需对投入产出表预处理，或使用 TABLO、R、Python 对已构建数据库拆分。
模块扩展
针对种植结构、农业补贴、农产品贸易以及库存等问题，需在标准全球或国家模型上添加或修改模块，使方程系统贴近真实农业活动。